From: A geometric and algebraic view of MHC-peptide complexes and their binding properties
Amino | Peptide amino acid position | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Acid | P1 | P2 | P3 | P4 | P5 | P6 | P7 | P8 | P9 |
A | 0.25 | 0.16 | 0.16 | 0.20 | 0.17 | 0.18 | 0.18 | 0.17 | 0.12 |
C | 0.10 | 0.05 | 0.14 | 0.11 | 0.04 | 0.11 | 0.06 | 0.06 | 0.03 |
D | 0.17 | 0.04 | 0.17 | 0.16 | 0.12 | 0.10 | 0.08 | 0.09 | 0.03 |
E | 0.16 | 0.16 | 0.09 | 0.13 | 0.10 | 0.08 | 0.11 | 0.32 | 0.02 |
F | 0.27 | 0.12 | 0.24 | 0.13 | 0.13 | 0.14 | 0.14 | 0.08 | 0.22 |
G | 0.15 | 0.14 | 0.10 | 0.15 | 0.12 | 0.14 | 0.11 | 0.13 | 0.09 |
H | 0.09 | 0.16 | 0.11 | 0.09 | 0.11 | 0.13 | 0.13 | 0.07 | 0.10 |
I | 0.16 | 0.14 | 0.20 | 0.12 | 0.12 | 0.20 | 0.13 | 0.19 | 0.35 |
K | 0.13 | 0.05 | 0.18 | 0.15 | 0.39 | 0.12 | 0.13 | 0.13 | 0.43 |
L | 0.21 | 0.26 | 0.15 | 0.18 | 0.15 | 0.17 | 0.18 | 0.16 | 0.32 |
M | 0.13 | 0.09 | 0.11 | 0.03 | 0.08 | 0.05 | 0.21 | 0.08 | 0.15 |
N | 0.11 | 0.08 | 0.09 | 0.13 | 0.12 | 0.14 | 0.08 | 0.10 | 0.09 |
P | 0.06 | 0.84 | 0.18 | 0.15 | 0.23 | 0.11 | 0.15 | 0.22 | 0.04 |
Q | 0.15 | 0.08 | 0.08 | 0.30 | 0.07 | 0.22 | 0.15 | 0.10 | 0.03 |
R | 0.42 | 0.71 | 0.29 | 0.18 | 0.16 | 0.16 | 0.16 | 0.12 | 0.23 |
S | 0.14 | 0.14 | 0.12 | 0.13 | 0.19 | 0.26 | 0.10 | 0.16 | 0.04 |
T | 0.14 | 0.18 | 0.13 | 0.15 | 0.12 | 0.11 | 0.37 | 0.16 | 0.06 |
V | 0.11 | 0.26 | 0.19 | 0.11 | 0.13 | 0.13 | 0.19 | 0.13 | 0.23 |
W | 0.05 | 0.07 | 0.08 | 0.13 | 0.06 | 0.08 | 0.13 | 0.07 | 0.10 |
Y | 0.12 A | 0.25 | 0.42 | 0.10 | 0.08 | 0.14 | 0.16 | 0.08 | 0.25 |
 | A | P | R | Q | P | G | L | M | A |
 | A | P | R | T | V | A | L | T | A |
 | A | P | R | Q | P | G | L | M | A |
 | A | P | R | T | V | A | L | T | A |
 | R | P | R | H | Q | G | V | M | V |
 | I | P | Y | H | I | V | N | I | V |
 | A | P | T | G | D | L | P | R | A |