Genotype 1b Vs 3a | Genotype 1b Vs 2a | Genotype 1b Vs 3a and 2a | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Trace residues (NS5A -1b) | Trace residues (NS5A -3A) | Blosum-62 substitution score | Trace residues (NS5A -1b) | Trace residues (NS5A -2A) | BLOSUM-62 substitution score | Trace residues (NS5A-1b) | Trace residues in (NS5A -3a and 2a) | BLOSUM-62 Substitution score | |
T244 | Q244 | 0 | K240 | R240 | 2 | I255 | V255 | V255 | 1 |
H247 | R247 | 0 | H247 | G247 | −2 | E256 | D256 | D256 | 2 |
D248 | P248 | −1 | P250 | Y250 | −3 | N276 | T276 | S272 | 0,1 |
S249 | H249 | −1 | A252 | V252 | −2 | E293 | D293 | D289 | 2 |
D253 | E253 | 2 | L254 | M254 | 2 | - | K384 | P380 | |
I255 | V255 | 1 | I255 | V255 | 1 | - | P385 | P381 | |
E256 | D256 | 2 | E256 | D256 | 2 | - | Q386 | S382 | |
G267 | S267 | 0 | L260 | F260 | 0 | - | E387 | G383 | |
N276 | T276 | 0 | W261 | - | - | E388 | D384 | ||
E293 | D293 | 2 | R262 | - | A387 | G394 | G390 | 0 | |
I302 | C302 | −1 | Q263 | - | T292 | S399 | D395 | 1,1 | |
G381 | P381 | −2 | E264 | - | A293 | S400 | S396 | 1 | |
- | K384 | I269 | V265 | 1 | - | V405 | T400 | ||
- | P385 | V272 | I268 | 3 | S401 | - | - | ||
- | Q386 | N276 | S272 | 1 | D402 | - | - | ||
- | E387 | I280 | V276 | 1 | G404 | - | - | ||
- | E388 | F284 | L280 | 0 | D405 | - | - | ||
A387 | G394 | 0 | L287 | M283 | 2 | ||||
S390 | T397 | 1 | A289 | E285 | −1 | ||||
G391 | Q398 | −2 | D292 | S288 | 0 | ||||
T392 | S399 | 1 | E293 | D289 | 2 | ||||
A393 | S400 | 1 | R294 | L290 | −2 | ||||
P396 | S403 | −1 | V298 | I294 | 3 | ||||
P397 | K404 | −1 | A300 | S296 | 1 | ||||
D398 | V405 | −3 | I302 | Y298 | −1 | ||||
Q399 | P406 | −1 | - | Q378 | |||||
D402 | P409 | −1 | - | P379 | |||||
D405 | E412 | 2 | - | P380 | |||||
G407 | - | - | P381 | ||||||
- | S382 | ||||||||
- | G383 | ||||||||
- | D384 | ||||||||
- | S385 | ||||||||
- | G386 | ||||||||
- | L387 | ||||||||
T389 | 1 | ||||||||
A391 | 1 | ||||||||
D392 | 0 | ||||||||
- | |||||||||
E404 | 2 | ||||||||
- | |||||||||
- | |||||||||
- | |||||||||
- | |||||||||
L407 | −4 |