Skip to main content

Table 1 PDB codes of the α -amylase homologs and the species from it was crystallized

From: Defining structural and evolutionary modules in proteins: a community detection approach to explore sub-domain architecture

PDB code

Species

PDB code

Species

1A47.A

T. thermosulfurigenes EM1

1PIF.A

S. scrofa

1AMY.A

H. vulgare

1PJ9.A

B. circulans

1AQH.A

P. haloplanctis

1PPI.A

S. scrofa

1AQM.A

P. haloplanctis

1QHO.A

B. stearothermophilus

1AVA.A

H. vulgare

1QHP.A

stearothermophilus

1B0I.A

P. haloplanctis

1S46.A

N. polysaccharea

1BAG.A

B. subtilis

1SMD.A

H. sapiens

1BF2.A

P. amyloderamosa

1TMQ.A

T. molitor

1BLI.A

B. licheniformis

1U33.A

H. sapiens

1BSI.A

H. sapiens

1UA3.A

S. scrofa

1BVZ.A

T. vulgaris R47

1UA7.A

B. subtilis

1CDG.A

B. circulans

1UOK.A

B. cereus

1CGT.A

B. circulans,s8

1VB9.A

T. vulgaris R47

1CGU.A

B. circulans,s8

1VFM.A

T. vulgaris R47

1CIU.A

T. thermosulfurigenes EM1

1VFO.A

T. vulgaris R47

1CLV.A

T. molitor

1VIW.A

T. molitor

1CXE.A

B. circulans

1VJS.A

B. licheniformis

1CXF.A

B. circulans

1WZK.A

T. vulgaris R47

1CXK.A

B. circulans

1WZL.A

T. vulgaris R47

1CXL.A

B. circulans

1WZM.A

T. vulgaris R47

1CYG.A

B. stearothermophilus

1ZS2.A

N. polysaccharea

1D3C.A

B. circulans

2AAA.A

A.niger

1DHK.A

S. scrofa

2QMK.A

H. sapiens

1EH9.A

S. solfataricus KM1

2QV4.A

H. sapiens

1EHA.A

S. solfataricus KM1

2TAA.A

A. oryzae

1G5A.A

N. polysaccharea

3BAI.A

H. sapiens

1G94.A

P. haloplanctis

3BAJ.A

H. sapiens

1GCY.A

P. stutzeri

3BAW.A

H. sapiens

1GJU.A

T. maritima

3BMV.A

T. thermosulfurigenes EM1

1GJW.A

T. maritima

3BMW.A

T. thermosulfurigenes EM1

1HNY.A

H. sapiens

3CGT.A

B. circulans,s8

1HVX.A

B. stearothermophilus B

3L2L.A

S. scrofa

1HX0.A

S. scrofa

3L2M.A

S. scrofa

1JAE.A

T. molitor

3UEQ.A

N. polysaccharea

1JFH.A

S. scrofa

4CGT.A

B. circulans,s8

1JG9.A

N. polysaccharea

5CGT.A

B. circulans,s8

1JGI.A

N. polysaccharea

6CGT.A

B. circulans,s8

1JIB.A

T. vulgaris R47

6TAA.A

A. oryzae

1KCL.A

B. circulans

7CGT.A

B. circulans,s8

1MVY.A

N. polysaccharea

7TAA.A

A. oryzae

1OB0.A

B. licheniformis

8CGT.A

B. circulans,s8

1OSE.A

S. scrofa

9CGT.A

B. circulans,s8

1OT1.A

B. circulans

  
  1. Only the chain A, corresponding to the catalytic domain, was used.
Back to article page

BMC Structural Biology

ISSN: 1472-6807

Contact us