Skip to main content

Advertisement

Table 1 PDB codes of the α -amylase homologs and the species from it was crystallized

From: Defining structural and evolutionary modules in proteins: a community detection approach to explore sub-domain architecture

PDB code Species PDB code Species
1A47.A T. thermosulfurigenes EM1 1PIF.A S. scrofa
1AMY.A H. vulgare 1PJ9.A B. circulans
1AQH.A P. haloplanctis 1PPI.A S. scrofa
1AQM.A P. haloplanctis 1QHO.A B. stearothermophilus
1AVA.A H. vulgare 1QHP.A stearothermophilus
1B0I.A P. haloplanctis 1S46.A N. polysaccharea
1BAG.A B. subtilis 1SMD.A H. sapiens
1BF2.A P. amyloderamosa 1TMQ.A T. molitor
1BLI.A B. licheniformis 1U33.A H. sapiens
1BSI.A H. sapiens 1UA3.A S. scrofa
1BVZ.A T. vulgaris R47 1UA7.A B. subtilis
1CDG.A B. circulans 1UOK.A B. cereus
1CGT.A B. circulans,s8 1VB9.A T. vulgaris R47
1CGU.A B. circulans,s8 1VFM.A T. vulgaris R47
1CIU.A T. thermosulfurigenes EM1 1VFO.A T. vulgaris R47
1CLV.A T. molitor 1VIW.A T. molitor
1CXE.A B. circulans 1VJS.A B. licheniformis
1CXF.A B. circulans 1WZK.A T. vulgaris R47
1CXK.A B. circulans 1WZL.A T. vulgaris R47
1CXL.A B. circulans 1WZM.A T. vulgaris R47
1CYG.A B. stearothermophilus 1ZS2.A N. polysaccharea
1D3C.A B. circulans 2AAA.A A.niger
1DHK.A S. scrofa 2QMK.A H. sapiens
1EH9.A S. solfataricus KM1 2QV4.A H. sapiens
1EHA.A S. solfataricus KM1 2TAA.A A. oryzae
1G5A.A N. polysaccharea 3BAI.A H. sapiens
1G94.A P. haloplanctis 3BAJ.A H. sapiens
1GCY.A P. stutzeri 3BAW.A H. sapiens
1GJU.A T. maritima 3BMV.A T. thermosulfurigenes EM1
1GJW.A T. maritima 3BMW.A T. thermosulfurigenes EM1
1HNY.A H. sapiens 3CGT.A B. circulans,s8
1HVX.A B. stearothermophilus B 3L2L.A S. scrofa
1HX0.A S. scrofa 3L2M.A S. scrofa
1JAE.A T. molitor 3UEQ.A N. polysaccharea
1JFH.A S. scrofa 4CGT.A B. circulans,s8
1JG9.A N. polysaccharea 5CGT.A B. circulans,s8
1JGI.A N. polysaccharea 6CGT.A B. circulans,s8
1JIB.A T. vulgaris R47 6TAA.A A. oryzae
1KCL.A B. circulans 7CGT.A B. circulans,s8
1MVY.A N. polysaccharea 7TAA.A A. oryzae
1OB0.A B. licheniformis 8CGT.A B. circulans,s8
1OSE.A S. scrofa 9CGT.A B. circulans,s8
1OT1.A B. circulans   
  1. Only the chain A, corresponding to the catalytic domain, was used.