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Table 2 List of pairs in RIPC set

From: Comparative Analysis of Protein Structure Alignments

  SCOP Domains Lengths   SCOP Classification  
Type Dom1 Dom2 L1 L2 SeqID Dom1 Dom2 Ref
I R d1he9a_ d1nfn__ 134 132 22.6 a.24.11.1 a.24.1.1 no
I C d1hcy_2 d1lnlb1 263 307 13.9 a.86.1.1 a.86.1.1 yes
I R d1afra_ d1jkua_ 345 266 19.2 a.25.1.2 a.25.1.3 no
I d1ay9b_ d1b12a_ 108 239 20.0 b.87.1.1 b.87.1.2 yes
I d1hx6a1 d1p2za2 230 312 16.5 b.121.2.1 b.121.2.2 no
I d1b09a_ d1dy4a_ 206 434 18.4 b.29.1.5 b.29.1.10 no
I R d1olza2 d2trcb_ 474 340 17.8 b.69.12.1 b.69.4.1 no
I d1gbg__ d1ovwa_ 214 398 19.5 b.29.1.2 b.29.1.10 yes
I d1ed9a_ d1p49a_ 449 548 18.8 c.76.1.1 c.76.1.2 no
I R d1xyza_ d2hvm__ 320 273 17.7 c.1.8.3 c.1.8.5 no
I d1crl__ d1ede__ 534 310 22.0 c.69.1.17 c.69.1.8 yes
I R d1cpo_1 d1cpo_2 120 179 14.8 a.39.3.1 a.39.3.1 no
I C d1jj7a_ d1lvga_ 251 190 21.1 c.37.1.12 c.37.1.1 yes
I d2adma_ d2hmyb_ 386 327 15.3 c.66.1.27 c.66.1.26 yes
I C d1lzy__ d148le_ 129 162 18.1 d.2.1.2 d.2.1.3 no
I d1an9a1 d1npx_1 247 198 19.3 c.4.1.2 c.3.1.5 yes
I C d1dmaa_ d1lt3a_ 204 226 21.3 d.166.1.1 d.166.1.1 no
I d1bmld3 d2sak__ 88 121 22.2 d.15.5.1 d.15.5.1 no
I d1ng4a2 d3cox_2 88 130 17.7 d.16.1.3 d.16.1.1 no
I d1aqza_ d1a2pa_ 142 108 16.0 d.1.1.3 d.1.1.2 no
P R d1nk1__ d1qdma1 78 77 24.3 a.64.1.1 a.64.1.2 yes
P d1d5ra1 d1rsy__ 133 135 21.8 b.7.1.1 b.7.1.2 no
P d1nls__ d2bqpa_ 237 228 43.9 b.29.1.1 b.29.1.1 yes
P d1qasa2 d1rsy__ 126 135 26.4 b.7.1.1 b.7.1.2 yes
P C d1b6a_1 d1bia_1 74 63 25.7 a.4.5.25 a.4.5.1 no
P R d1b5ta_ d1k87a2 275 351 17.5 c.1.23.1 c.1.23.2 yes
P I d1jwyb_ d1puja_ 281 261 20.2 c.37.1.8 c.37.1.8 yes
P I d1jwyb_ d1u0la2 281 212 19.5 c.37.1.8 c.37.1.8 yes
P I d1nw5a_ d2adma_ 270 386 16.4 c.66.1.11 c.66.1.27 yes
P C d1gsa_1 d2hgsa1 122 102 15.6 c.30.1.3 c.30.1.4 yes
P I d1qq5a_ d3chy__ 245 128 20.2 c.108.1.1 c.23.1.1 yes
P I d1kiaa_ d1nw5a_ 275 270 19.9 c.66.1.5 c.66.1.11 yes
C R d1aj3__ d2spca_ 98 107 22.2 a.7.1.1 a.7.1.1 no
C R d2bbma_ d4cln__ 148 148 100.0 a.39.1.5 a.39.1.5 yes
C R d1dlia1 d1mv8a1 98 98 26.3 a.100.1.4 a.100.1.4 yes
I C d1hava_ d1kxf__ 216 159 20.1 b.47.1.4 b.47.1.3 yes
C d1l5ba_ d1l5ea_ 101 101 100.0 b.89.1.1 b.89.1.1 yes
I C d1adl__ d1mup__ 131 157 14.1 b.60.1.2 b.60.1.1 no
C d1ggga_ d1wdna_ 220 223 100.0 c.94.1.1 c.94.1.1 yes
I C d1d5fa_ d1nd7a_ 350 374 34.6 d.148.1.1 d.148.1.1 yes
  1. Type: Type of difficulty for alignment algorithms. R: Repetitions, I: Insertions, P: Permutation, C: Conformational changes. SeqID: Sequence identity in percent. Ref: A reference alignment is available to evaluate alignment accuracy.