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Table 9 SOM predictions for the proteins with unknown function in structural genomics

From: Exploring functionally related enzymes using radially distributed properties of active sites around the reacting points of bound ligands

PDB (Ligand)

SOM

ETA

1h2hA (NAD)

1.3.1.26

1.4.1, 4.3.1

1npdA (NAD)

1.14.99.3

1.1.1, 5.4.99

1o61A (PLP)

2.1.1.104

2.6.1, 6.3.4

1o8cA (NDP)

1.1.1.2

2.3.3, 5.4.4, 6.3.2

1rljA (FMN)

1.8.1.2

2.4.1

1t57A (FMN)

1.8.1.9

3.2.1

1ue8A (HEM)

1.2.1.9

1.14.14, 2.3.2, 2.7.7, 3.5.4, 3.6.1, 4.2.99, 5.1.3

1ve3A (SAM)

2.1.1.104

2.1.1, 3.1.3

1ve3B (SAM)

2.6.1.1

2.1.1, 3.1.3, 3.5.3, 5.1.3

1xq6A (NAP)

1.2.4.4

1.6.5

1y81A (COA)

2.3.1.85

1.13.11, 2.3.2, 2.7.10, 2.8.1, 3.6.1, 3.6.3, 4.1.2, 4.3.1, 6.3.2

1yoaA (FAD)

1.3.1.24 1.5.1.30

1.3.1, 1.6.8, 2.7.4, 3.4.21, 3.7.1

1yreD (COA)

2.1.1.79

1.1.1, 2.3.1, 3.4.11, 3.4.22, 4.2.99

2e6uX (COA)

2.5.1.18

3.5.1

2eisA (COA)

2.5.1.6

3.1.2

2gluA (SAM)

2.3.1.168

2.1.1, 3.4.24

2gqfA (FAD)

1.3.1.26

1.1.1, 1.18.6, 1.3.3, 1.7.1, 2.7.1, 2.7.7, 3.2.1, 3.3.2, 3.4.21, 4.1.1, 6.3.3, 6.3.5

2gswA (FMN)

1.18.1.2

1.5.1, 1.7.1, 3.1.4

2ptfA (FMN)

1.8.1.7

1.14.13

2q46A (NAP)

1.2.4.4

1.6.5

3cgvA (FAD)

1.14.14.1

2.4.1, 6.1.1

3dmeB (FAD)

1.18.1.2

3.5.2

3f2vA (FMN)

1.6.5.2, 1.6.99.2

1.10.99

  1. The EC numbers compatible with the bound ligands are shown in bold font.