Helical ambivalency induced by point mutations

BMC Structural Biology

Table 2 Estimated number of times a helical sequence gets mapped into another helical conformation in SCOP database when a particular amino acid (first column) is mutated by 19 other amino acids (first row)

Non-helix→	A	C	D	E	F	G	H	I	K	L	M	N	P	Q	R	S	T	V	W	Y
Helix↓
A	0	208	750	1293	641	487	339	929	1028	1759	388	506	280	784	899	703	661	951	238	507
C	191	0	86	149	74	56	39	107	118	203	44	58	32	90	103	81	76	109	27	58
D	773	97	0	602	298	226	158	433	479	820	181	235	130	365	419	327	308	443	111	236
E	1413	177	638	0	545	414	288	791	875	1497	330	430	238	667	765	598	562	809	203	431
F	651	81	294	507	0	190	133	364	403	690	152	198	110	307	352	275	259	373	93	198
G	482	60	217	375	186	0	98	270	298	511	112	147	81	228	261	204	192	276	69	147
H	333	41	150	259	128	97	0	186	206	353	78	101	56	157	180	141	132	191	47	101
I	996	125	450	776	384	292	203	0	617	1056	233	303	168	470	539	422	396	570	143	304
K	1086	136	490	846	419	318	222	608	0	1151	254	331	183	513	588	460	432	622	156	331
L	1863	234	841	1451	719	546	380	1043	1153	0	436	568	314	880	1009	789	742	1067	267	569
M	348	43	157	271	134	102	71	195	215	369	0	106	58	164	188	147	138	199	50	106
N	528	66	238	411	204	154	107	295	327	560	123	0	89	249	286	223	210	302	75	161
P	280	35	126	218	108	82	57	157	173	297	65	85	0	132	151	118	111	160	40	85
Q	791	99	357	616	305	232	161	443	490	839	185	241	133	0	428	335	315	453	113	241
R	937	117	423	730	362	274	191	524	580	993	219	285	158	443	0	397	373	537	134	286
S	719	90	325	560	277	211	147	402	445	762	168	219	121	340	389	0	286	412	103	219
T	658	82	297	512	254	193	134	368	407	697	154	200	111	311	356	278	0	377	94	201
V	981	123	443	764	379	287	200	549	607	1040	229	299	165	463	531	415	390	0	141	299
W	234	29	105	182	90	68	47	131	144	248	54	71	39	110	126	99	93	134	0	71
Y	552	69	249	430	213	161	112	309	341	584	129	168	93	260	299	233	219	316	79	0

ISSN: 1472-6807